В последнее время участилась порча файлов level.dat и level_sponge.dat!
В первом хранятся данные forge о ID предметов, во втором же файле хранится некоторая информация о блоках, например UUID поставившего его игрока.
По словам Zidane (один из главных разработчиков проекта), в последней сборке SpongeVanilla и SpongeForge есть возможный фикс проблемы.
Проблема чаще всего встречается на SpongeForge.
Также было выявлено, что отмена UnloadWorldEvent для главного мира(Overworld) во время выключения сервера приводит к порче данных файлов.